La Struttura Nefrologia e Dialisi dell'Ospedale San Giuseppe di Empoli riceve assistiti affetti da patologie renali acute o croniche, da patologie immunologiche con interessamento nefrologico, dal diabete con interessamento renale, da policistosi e calcolosi renale e da ipertensione con danno renale correlato. Offre inoltre ambulatori specialistici che permettano a tali assistiti di essere seguiti dal prelievo alla terapia fino agli eventuali esami strumentali da eseguire. Se la patologia renale evolve verso una patologia cronica con perdita della funzione renale si offrono ambulatori che permettano di avvicinarsi alla dialisi, sempre più consapevoli della patologia e del percorso più adatto alla malattia e alle necessità domiciliari.
Il percorso del trapianto renale viene seguito sia nel suo inserimento in lista per il ricevimento dell'organo, sia nel suo iter successivo al trapianto.