La Struttura è specializzata nella gestione della patologia tiroidea ed è accreditata come Unit di chirurgia tiroidea dalla SIUEC, Società Italiana Unitaria di Endocrino Chirurgia. L'Ospedale SS. Cosma e Damiano di Pescia è centro di riferimento di chirurgia della tiroide per la USL Toscana Centro. La Struttura tratta tutta la patologia tiroidea, sia quella non oncologica, come i gozzi e le tiroiditi, che quella oncologica. Si occupa inoltre di chirurgia della parete addominale con interventi finalizzati alla riparazione di più o meno complessi difetti della parete addominale. Tratta anche la patologia proctologica sia a livello ambulatoriale che in sala operatoria, con interventi medici e chirurgici finalizzati a risolvere i più comuni e frequenti problemi in questo ambito, come la patologia emorroidaria, le fistole anali e le ragadi anali.